贞观十年六月，立政殿里，三十六岁的长孙皇后已到弥留。据《旧唐书·后妃传》和《资治通鉴》，她与太宗诀别时还在交代国事：房玄龄侍奉陛下多年，小心缜密，奇谋秘计从不曾泄露，若没有大过，不要轻易抛弃；自己的宗族因为是外戚才得到高位，既不是靠德行上来的，就容易倾覆，要想保全子孙，就别让他们处在权要的位置，只以外戚身份按时朝见，也就够了。一个临终的人，先想的是别让外戚干政，别让功臣受屈。
她还替自己的丧事立了规矩。她对太宗说，自己活着对当世没什么益处，死了不能厚葬破费；葬就是藏，是让人看不见，自古圣贤都崇尚俭薄，只有无道之世才大起山陵、劳费天下，被有识者笑话；她只求依山而葬，不必起坟，不必用厚重棺椁，随葬器物用陶瓦木器，俭薄送终，就是不忘记自己。太宗后来为她在九嵕山营建昭陵，凿石的工匠只用一百多人，几十天完工，墓中不藏金玉，人马器皿都用土木，只具形状，并亲自撰文刻石，要让百世子孙奉为法度。
这位十三岁就嫁给李世民的鲜卑后裔，一生的分寸都刻在守礼克己四个字上。她好读书，常与太宗从容谈古，却从不在太宗发火处置宫人宫官时火上浇油，总要等皇帝气消，再慢慢替人申辩，宫中很少有冤枉的刑罚。她采辑自古以来妇人得失的故事编成《女则》三十卷，还写文章批评东汉明德马皇后不能抑退外戚，只知告诫车如流水、马如龙，是堵住了末流却敞开了祸源。这部书在她崩逝后由宫中官员奏上，太宗看了悲恸，对近臣说这书足以垂范百世。《女则》后世散佚，今天已经看不到了。
她最有名的一件事，是护住魏征。《资治通鉴》载，太宗有一次罢朝回宫大怒，嫌魏征总在朝廷上当众让自己下不来台。长孙皇后问明缘由，退回内室换上只有参加大典才穿的朝服，站到庭中向太宗道贺。太宗惊问其故，她说：妾听说君主圣明，臣子才敢忠直，如今魏征敢直言，正是因为陛下圣明。太宗听罢转怒为喜。她用最庄重的礼仪，替直臣挡下一场杀身之祸，也替丈夫保住了纳谏的名声。
贞观十年六月二十一日，长孙皇后崩于立政殿，十一月葬入昭陵。太宗思念不已，在苑中筑起层观，登上去遥望昭陵，还拉魏征一起。魏征故意说自己老眼昏花看不见，等太宗指明方向，才说臣以为陛下望的是高祖的献陵，若是皇后的昭陵，臣早就看见了，婉谏皇帝思妻不可逾于思父。太宗听罢哭着下令拆毁那座层观。贤后而不干政，受宠而不引宗族，她把皇后这个位置，坐出了克制的分量。
❝但请因山而葬，不须起坟，无用棺椁，所须器服，皆以木瓦，俭薄送终。❞