嘉靖初年的南京太医院，院使薛己做出一个让同僚意外的决定：辞官回乡。当时的医界盛行用黄柏、知母一派苦寒药降火，许多人不分虚实就投大剂寒凉，病人脾胃受伤，病情反而加重。他在后来的书里写下责问：世上把脾虚误认作肾虚的，动辄便用黄柏、知母，反伤了胃中的生气，这样害人的事太多了。这正是他回乡后要全力纠偏的风气。
薛己，字新甫，号立斋，江苏吴县人，生于明成化二十三年。父亲薛铠本是太医院的医官，著有《保婴撮要》，他幼承家学，年轻时先以外科、儿科成名，正德年间被选为御医，后升太医院判，嘉靖初年做到南京太医院院使。他不是只通一技的医官，内、外、妇、儿、口齿诸科都下过功夫，临床各科医案都写得平实有据，这在分科日趋细密的明代医家中并不多见。
辞官之后的二十余年，是他著述的丰收期。他校勘、增补并自撰的医书有《内科摘要》《外科发挥》《女科撮要》《口齿类要》《正体类要》等十六种，后人汇为《薛氏医案》。学术上，他上承李东垣重视脾胃的路数又更进一步，既讲脾胃为后天之本，又重命门肾火，主张用甘温之剂补益元气、滋生化之源，反对动辄克伐。他校注钱乙《小儿药证直诀》，把书中六味地黄丸等名方推广到成人虚损诸证；又为陈自明《妇人良方》作校补，临证常用补中益气汤、八味丸，温补脾肾、化裁成方，由此开出明代的温补学派，下启赵献可、张景岳、李中梓诸家。
他在伤科上的贡献尤其特殊。《正体类要》二卷成书于嘉靖八年，上卷列理伤大法与仆伤、坠跌、金疮、汤火的治验，下卷载诸伤方剂。他提出肢体损伤于外、气血必伤于内，反对只靠手法外治，主张详辨脉理虚实，从脾肾气血入手内治，为骨伤科开出辨证内治的一脉。清代官修《医宗金鉴·正骨心法要旨》专立伤科一门，即以这部书为重要蓝本；后世通行的摸、接、端、提、按、摩、推、拿正骨八法虽定型于《医宗金鉴》，其理法渊源也有薛氏的一份。近代医史学者谢利恒论伤科源流，说骨伤一科此前传书极少，薛氏书独有之，清代官修伤科之书即取资于此，其功不可没。
嘉靖三十八年，薛己去世，年七十三。他的方书里没有什么僻药奇方，常用的不过补中益气、八珍、六味地黄一类寻常方子，他肯下功夫的，是辨明何时该用、为何而用。一个太医院的最高医官，留给后世的不是几个秘方，而是一整套以温补救偏弊的辨证思路。
❝世以脾虚误为肾虚，辄用黄柏、知母之类，反伤胃中生气，害人多矣。（大意）❞